Marcello Gatti ha compiuto gli studi musicali e di flauto traverso a Perugia (Italia) e di musica antica a Verona. Successivamente, sotto la guida di Barthold Kuijken presso il Conservatorio Reale dell’Aia (Paesi Bassi) si è laureato con lode nel 1997.
Particolarmente apprezzato dalla critica per il suo sensibile virtuosismo, la grande cantabilità e la competenza stilistica, ha tenuto concerti in tutto il mondo, eseguendo con flauti traversi rinascimentali, barocchi, classici, romantici, un vastissimo repertorio, come solista e in seno a formazioni cameristiche e orchestrali tra le più rinomate e specializzate nel settore: Ensemble Aurora, Ensemble Zefiro, Europa Galante, Accademia Bizantina, Le Concerts de Nations, Amsterdam Baroque Orchestra, L’Orfeo Barock Orchester, Il Pomo d’Oro, Hofkapelle München, Cantus Cölln, Attaignant Consort, Tafelmusik, Ensemble 1700, Hofkapelle Stuttgart, Salzburger Hofmusik e molti altri.
Ha partecipato a oltre 90 produzioni tra audio e video registrazioni con strumenti storici.
Dal 1995 si dedica con entusiasmo all’insegnamento e ha tenuto corsi e masterclasses in numerosissime istituzioni. Dopo aver insegnato regolarmente in Italia e presso la Hochschule “Felix Mendelssohn Bartholdy” di Lipsia (D), è dal 2014 professore di flauto traverso storico  nella prestigiosa Università Mozarteum di Salisburgo (Austria) oltre che ai corsi estivi dell’Accademia Musicale Chigiana (Siena) e della Fondazione Italiana Musica Antica ad Urbino.